截至2008年底，已运营地铁包括1号线、2号线、13号线、八通线、5号线、10号线一期（含奥运支线）、机场线，运营历程约200公里，公司依股权对所投资的轨道交通项目实施价值管理，以多种方式盘活存量资产，实现国有资产保值增值。通过合同契约与运营单位建立了委托关系。

地铁13号线 
     北京地铁13号线于1999年12月开工，2003年1月28日全线通车试运营，线路全长40.85公里，共设车站16座，工程总投资65.7亿元。2007年，地铁13号线全年客运量达8902万人次，比2006年增长23.6%。

2007年，城铁公司与北京市轨道交通建设管理有限公司、北京市地铁运营有限公司共同签订了《北京城市铁路设备设施清单确认协议书》，同时完成了地铁13号线设备设施清单的交接工作。此项工作的完成为未来实施信息化管理奠定了基础。

地铁5号线

北京地铁5号线2002年12月开工建设，至2007年底已累计完成投资107亿元。10月7日，全线通车试运营、线路全长27.6公里，共设车站23座，日均客流量达43.7万人次。

地铁5号线项目通过最优惠利率人民币贷款、短期融资券、出口信贷、信托计划、引入全国社会保障资金等多种方式，饼采用长短贷结合、实时拨款等财务管理手段，最大限度地减少资金沉淀，建设资金成本比概算节约近2亿元。

地铁八通线

1998年7月，北京地铁京通发展有限责任公司注册成立，注册资本14亿元。其中：北京市基础设施投资有限公司出资5.9亿元，占42.14%。2007年7月，北京城市铁路股份有限公司正式接管京通公司，主要负责地铁八通线尾工工程建设、投融资管理、资产管理、运营协调、资源开发、多种经营、土地管理等工作。

地铁八通线是北京地铁一号线的东延长线，2001年12月开工，2003年12月全线通车试运营。线路全长18.96公里，共设车站13座，工程总投资34亿元。2007年，八通线客运量3888万人次，比2006年增长15%。